fdupes est utilitaire en ligne de commande qui permet de retrouver très rapidement les fichiers en doublon présents sur vos espaces de stockage. Pour repérer les doublons, il ne se base pas sur le nom des fichiers mais les identifie en comparant la signature MD5 des fichiers suivie d'une comparaison octet à octet. Cet utilitaire, écrit en C, sous licence MIT, possède de très nombreuses options afin de répertorier, supprimer et remplacer les fichiers.

Voici la chaîne de comparaison utilisée

1/ Comparaison de taille
2/ Comparaison de signature MD5 partielle
3/ Comparaison de signature MD5 complète
4/ Comparaison octet à octet.

Sous base DEBIAN

# apt-get install fdupes

Sous base UBUNTU

$ sudo apt-get install fdupes

Sous freeBSD, depuis les repos

 # pkg install fdupes

Sous freeBSD, depuis les ports

# cd /usr/ports/sysutils/fdupes/
# make install clean

 fdupes <option> <répertoire>

Soit un répertoire, dupli-test contenant 3 fichiers distincts de nom et de contenu.

$ ls test-dupli/
aze1.txt  aze3.txt  aze.txt

Utilisons un GUI et copions les, via ctrl +C / ctrl + V :

$ ls test-dupli/
'aze1 (copie 1).txt'  'aze3 (copie 1).txt'  'aze (copie 1).txt'
'aze1 (copie 2).txt'  'aze3 (copie 2).txt'  'aze (copie 2).txt'
'aze1 (copie 3).txt'  'aze3 (copie 3).txt'  'aze (copie 3).txt'
'aze1 (copie 4).txt'  'aze3 (copie 4).txt'  'aze (copie 4).txt'
'aze1 (copie 5).txt'  'aze3 (copie 5).txt'  'aze (copie 5).txt'
'aze1 (copie 6).txt'  'aze3 (copie 6).txt'  'aze (copie 6).txt'
 aze1.txt              aze3.txt              aze.txt

Pour rechercher les doublons, en être informé, sans aucune autre action, pas besoin d'option :

$ fdupes  test-dupli/
test-dupli/aze3.txt                     
test-dupli/aze3 (copie 1).txt
test-dupli/aze3 (copie 3).txt
test-dupli/aze3 (copie 2).txt
test-dupli/aze3 (copie 6).txt
test-dupli/aze3 (copie 5).txt
test-dupli/aze3 (copie 4).txt
 
test-dupli/aze.txt
test-dupli/aze (copie 1).txt
test-dupli/aze (copie 3).txt
test-dupli/aze (copie 2).txt
test-dupli/aze (copie 5).txt
test-dupli/aze (copie 4).txt
test-dupli/aze (copie 6).txt
 
test-dupli/aze1.txt
test-dupli/aze1 (copie 1).txt
test-dupli/aze1 (copie 3).txt
test-dupli/aze1 (copie 2).txt
test-dupli/aze1 (copie 4).txt
test-dupli/aze1 (copie 6).txt
test-dupli/aze1 (copie 5).txt

Pour rechercher les doublons, en être informé, et connaitre l'espace disque qu'ils utilisent, utiliser l'option -S (Size) :

$ fdupes -S test-dupli/
13 bytes each:                          
test-dupli/aze3.txt
test-dupli/aze3 (copie 1).txt
....
test-dupli/aze3 (copie 4).txt
 
169 bytes each:
test-dupli/aze.txt
test-dupli/aze (copie 1).txt
....
test-dupli/aze (copie 6).txt
 
49 bytes each:
test-dupli/aze1.txt
test-dupli/aze1 (copie 1).txt
....
test-dupli/aze1 (copie 5).txt

Pour supprimer les doublons, utiliser l'option -d (delete) :

Pour chaque doublon, une liste sera proposée, il faudra indiquer le fichier à préserver et les autres seront marqués à supprimer.

Pour supprimer les doublons, sans invite prompt (le nom le plus simple sera alors préserver), utiliser les options -d et -N (Non-prompt) La suppression sera alors immédiate.

Pour faire de de même de façon récursive, ajouter aux options précédentes simplement l'option -r :

 $ fdupes -rdN .

Donnera une suppression récursive des doublons du répertoire courant (.)

 $ fdupes -rS /home/$USER

Donnera la liste des doublons et leurs occupations disques pour le /home de l'utilisateur courant.

Pour sauvegader cette liste dans un fichier, utiliser une redirection

 $ fdupes -rS /home/$USER > /home/$USER/liste-de-doublons

A savoir, 2 fichiers au même contenu mais avec des noms différents seront considérés comme doublon, même avec des extensions différentes.

$ cat test-dupli/aze.txt test-dupli/test.sh 
Test de doubon. Test de doubon. Test de doubon. Test de doubon. Test de doubon. 
Test de doubon. Test de doubon. Test de doubon. Test de doubon. Test de doubon.

On voit bien que les 2 fichiers ont exactement le même contenu.

$ fdupes  -rS test-dupli/
81 bytes each:                          
test-dupli/aze.txt
test-dupli/test.sh

fdupes les analyse bien comme doublon.

Pour ne pas prendre en compte les fichiers cachés, utiliser l'option -A.

Pour des plus amples informations

$ man fdupes
$ fdupes --help
$ fdupes -h